44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1001 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  97.83 
 
 		 184 aa  358  3e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  97.83 
 
 		 184 aa  358  3e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  86.96 
 
 		 184 aa  327  6e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  66.3 
 
 		 186 aa  243  9e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  49.44 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  48.57 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  44 
 
 		 178 aa  150  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  43.75 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  40.88 
 
 		 180 aa  148  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  43.89 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  44.25 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  44.38 
 
 		 180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  45.14 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  44.85 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  42.35 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  45.14 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  39.89 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  41.24 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  36.46 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  37.85 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  40.82 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  36.47 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  42.86 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  44.64 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  37.41 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  38.1 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  35.42 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  31.13 
 
 		 356 aa  75.5  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  31.82 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  30.3 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  33.83 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  29.32 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  32.41 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  27.38 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  26.99 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  28.05 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  28.67 
 
 		 266 aa  52.4  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07600  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  33.33 
 
 		 742 aa  45.1  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.722392 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.52 
 
 		 698 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000243364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3583  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  28.89 
 
 		 770 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.03 
 
 		 786 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.88 
 
 		 686 aa  41.6  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00293848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0784  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.78 
 
 		 767 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>