33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1750 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 180 aa  361  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  54.14 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  52.75 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  52.78 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  51.98 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  50 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  47.16 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  50.6 
 
 		 174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  42.94 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  42.37 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  41.24 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  41.81 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  44.94 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  43.93 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  44.13 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  44.38 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  44.38 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  44.38 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  42.13 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  37.85 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  39.41 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  37.33 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  37.06 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  35.48 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  41.38 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  33.11 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  33.33 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  30.34 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  25 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  24.7 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  26.35 
 
 		 257 aa  49.3  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  26.22 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89194  predicted protein  27.45 
 
 		 310 aa  42  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915191  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>