39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0948 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 178 aa  355  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  56.82 
 
 		 182 aa  222  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  58.96 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  51.76 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  43.82 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  44.94 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  47.16 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  42.7 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  47.19 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  42.7 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  43.68 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  42.46 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  44.57 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  44.57 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  44 
 
 		 184 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  42.53 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  41.67 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  44 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  39.33 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  38.64 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  35.59 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  36.54 
 
 		 189 aa  99.4  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  33.87 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  34.03 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  30.77 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  29.73 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  30.28 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  29.33 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  28.21 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12796  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.71 
 
 		 752 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1738  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  44.29 
 
 		 750 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3954  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  38.57 
 
 		 762 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0796905  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  26.61 
 
 		 358 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  27.94 
 
 		 257 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5823  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.57 
 
 		 747 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.410349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1541  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 717 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2164  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.43 
 
 		 759 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00328934  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0784  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.81 
 
 		 767 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3279  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 718 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.825925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>