174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2550 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2550  efflux ABC-transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  30.7 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  27.6 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  29.58 
 
 		 273 aa  85.1  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  25.98 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  28.17 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  27.63 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  24.24 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  24.29 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  25.34 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  22.9 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.07 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  26.98 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  30.36 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  27.83 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  27.83 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.96 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  28.7 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  27.48 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  27.36 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1313  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368172  normal  0.0367769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  27.57 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  23.56 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  26.99 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  24.27 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  25.71 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  24.76 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0674  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000817714  decreased coverage  0.000103692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  23.48 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  20.18 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  25.94 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2182  ABC polysaccharide/polyol phosphate export systems, inner membrane subunit  23.87 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.718271  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  21.95 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  22.52 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.47 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14690  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.23 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  hitchhiker  0.00000217507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4146  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  hitchhiker  0.00000138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0595  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  21.83 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  23.04 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 606 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  22.26 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>