214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1687 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1116    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  38.4 
 
 		 575 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  29.42 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  33.91 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  32.02 
 
 		 569 aa  267  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  33.78 
 
 		 569 aa  264  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  32.01 
 
 		 544 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  31.2 
 
 		 607 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  31.08 
 
 		 594 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.35 
 
 		 593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  30.08 
 
 		 587 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  32.77 
 
 		 591 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  32.66 
 
 		 679 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 579 aa  233  8.000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  32.23 
 
 		 577 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  29.64 
 
 		 623 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  29.93 
 
 		 579 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  33.27 
 
 		 628 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  30.59 
 
 		 591 aa  221  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  32.3 
 
 		 582 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  32.1 
 
 		 583 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  29.56 
 
 		 709 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  32.46 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  28.4 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  32.23 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  29.91 
 
 		 583 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  31.15 
 
 		 617 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  29.88 
 
 		 693 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  27.95 
 
 		 674 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  30.86 
 
 		 584 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  29.59 
 
 		 612 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  32.44 
 
 		 559 aa  200  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  31.26 
 
 		 590 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  28.68 
 
 		 560 aa  196  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  28.16 
 
 		 679 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  29.35 
 
 		 626 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  28.54 
 
 		 662 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  30.18 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  27.72 
 
 		 567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  37.39 
 
 		 664 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  26.95 
 
 		 497 aa  143  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  35.05 
 
 		 709 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  24.56 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.66 
 
 		 497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  24.9 
 
 		 493 aa  137  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  33.45 
 
 		 714 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  26.47 
 
 		 574 aa  133  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  26.57 
 
 		 557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  35.91 
 
 		 674 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  27.02 
 
 		 427 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  28.44 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  24.79 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  26.05 
 
 		 496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  33.48 
 
 		 659 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  25.87 
 
 		 564 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  38.73 
 
 		 670 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  25.67 
 
 		 520 aa  124  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.92 
 
 		 500 aa  123  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  28.61 
 
 		 563 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  31.58 
 
 		 617 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 492 aa  120  7.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  26.01 
 
 		 570 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.91 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.57 
 
 		 605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  26.07 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.95 
 
 		 616 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  32.98 
 
 		 603 aa  109  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  27.82 
 
 		 524 aa  107  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  31.4 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  25.05 
 
 		 559 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  25.14 
 
 		 557 aa  104  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.37 
 
 		 581 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  31.34 
 
 		 611 aa  97.1  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  30.56 
 
 		 608 aa  94  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  21.87 
 
 		 560 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  38.16 
 
 		 531 aa  89.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 561 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  26.64 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  34.29 
 
 		 628 aa  77.4  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  24.41 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  27.53 
 
 		 589 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  33.61 
 
 		 524 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  34.43 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  26.55 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  34.78 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  28.68 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  25.79 
 
 		 1071 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  29.56 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  27.44 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  23.26 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  23.7 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  31.62 
 
 		 580 aa  63.9  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  36.61 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  32.23 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  36.61 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  33.04 
 
 		 608 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  23.36 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  33.04 
 
 		 608 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  37.5 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  40.71 
 
 		 534 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>