More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0982 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  100 
 
 
176 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  48.34 
 
 
173 aa  141  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 
169 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  37.34 
 
 
195 aa  101  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  35.57 
 
 
151 aa  99  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  47.12 
 
 
153 aa  97.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  35.71 
 
 
148 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
148 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
148 aa  94.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  32.4 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
144 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
147 aa  89.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  36.31 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
139 aa  87  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
147 aa  86.3  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  42.98 
 
 
145 aa  85.9  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 
145 aa  85.5  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
150 aa  84.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
148 aa  84  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
149 aa  84  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  39.64 
 
 
142 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  41.49 
 
 
153 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  28.38 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  40.66 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.05 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  31.75 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  29.05 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  33.64 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  33.64 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  28.57 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.86 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  30.86 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  30.32 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  31.14 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
140 aa  77  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  30.41 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  37.1 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  36.8 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  33.09 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  30.72 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  29.37 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.37 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  33.7 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.65 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.21 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  33.55 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  30.77 
 
 
134 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
145 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  32.77 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  34 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  30.25 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.75 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  37.19 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  32.47 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  32.52 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  33.65 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>