126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03900 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  60.79 
 
 		 537 aa  661    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  59.81 
 
 		 524 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  64.56 
 
 		 526 aa  710    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  58.75 
 
 		 517 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  62.17 
 
 		 524 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  100 
 
 		 522 aa  1097    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  58.78 
 
 		 514 aa  618  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  55.81 
 
 		 508 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  51.47 
 
 		 514 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  50.58 
 
 		 520 aa  535  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  49.52 
 
 		 525 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  47.13 
 
 		 543 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  47.32 
 
 		 543 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  46.95 
 
 		 543 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  47.69 
 
 		 543 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  47.81 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  49.72 
 
 		 531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  48.82 
 
 		 527 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  45.47 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  44.53 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  45.88 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  46.98 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  44.27 
 
 		 524 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  45.88 
 
 		 513 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  43.49 
 
 		 513 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  43.49 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  43.1 
 
 		 513 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  43.1 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  41.6 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  43.76 
 
 		 507 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  41.65 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  41 
 
 		 508 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  40 
 
 		 524 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  42.56 
 
 		 522 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  43.35 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  41.23 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  38.97 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  37.59 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  39.96 
 
 		 507 aa  362  8e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  37.6 
 
 		 515 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  37.12 
 
 		 511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  36.99 
 
 		 510 aa  333  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.01 
 
 		 501 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  35.32 
 
 		 501 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.13 
 
 		 517 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  31.75 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  31.75 
 
 		 529 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  34.36 
 
 		 506 aa  249  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.36 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 499 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  29.94 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  30.13 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  30.5 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 499 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  33.08 
 
 		 492 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  34.46 
 
 		 515 aa  237  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  32.18 
 
 		 538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  32.19 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  33.08 
 
 		 497 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  34.44 
 
 		 504 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  34.04 
 
 		 505 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  31.67 
 
 		 496 aa  230  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  31.6 
 
 		 501 aa  230  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  32.07 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  31.14 
 
 		 538 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  31.14 
 
 		 538 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  31.14 
 
 		 538 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.11 
 
 		 509 aa  227  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.66 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  29.17 
 
 		 511 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  30.58 
 
 		 501 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  34.62 
 
 		 507 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  32.29 
 
 		 501 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  30.32 
 
 		 507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  30.89 
 
 		 538 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  30.32 
 
 		 502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  30.66 
 
 		 538 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  31.59 
 
 		 523 aa  220  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  29.77 
 
 		 510 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  29.96 
 
 		 500 aa  219  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  31.07 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  30.65 
 
 		 503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  29.62 
 
 		 505 aa  216  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  29.69 
 
 		 494 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  32.1 
 
 		 505 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  30.21 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  32.63 
 
 		 518 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  30.53 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  31.21 
 
 		 537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.54 
 
 		 495 aa  213  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  32.16 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  30.23 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  32.92 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  31.02 
 
 		 498 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  32.64 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  30.27 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  29.82 
 
 		 505 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  31.93 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  30.82 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>