More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01587 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01587  HD-GYP domain protein  100 
 
 		 379 aa  779    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1029  metal dependent phosphohydrolase  69.13 
 
 		 379 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1267  metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 		 372 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.453664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2257  metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.38047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2364  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9865  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0657  metal-dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2906  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 		 505 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  34.88 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 496 aa  99.4  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  36.57 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 495 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 199 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 		 861 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 		 545 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  35.92 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  31.05 
 
 		 550 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 836 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 		 648 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  29.95 
 
 		 334 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  31.9 
 
 		 509 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  37.58 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  32.75 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  31.89 
 
 		 334 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  34.42 
 
 		 572 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  31.82 
 
 		 339 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 647 aa  90.9  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.75 
 
 		 853 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  38 
 
 		 362 aa  89.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 		 334 aa  89.4  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3878  metal dependent phosphohydrolase  40.19 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 643 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  35.66 
 
 		 561 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 643 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 643 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2799  metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 		 462 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 643 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 		 647 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  26.7 
 
 		 564 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 		 642 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  33.15 
 
 		 474 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 		 389 aa  86.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  38.68 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 346 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 		 643 aa  86.3  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  30.43 
 
 		 563 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 		 642 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 		 451 aa  86.3  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 467 aa  85.9  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  29.94 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  29.94 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0810  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  29.94 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  35.97 
 
 		 316 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  31.01 
 
 		 599 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 642 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0839  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 631 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.77 
 
 		 755 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  29.94 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  32.6 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 683 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 571 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 736 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.37 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 		 654 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  29.38 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  38.46 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0504  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 599 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 905 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  34.4 
 
 		 803 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  31.14 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>