48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00253 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  100 
 
 		 418 aa  847    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  29.41 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  30.58 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  28.57 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  29.08 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  28.84 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  22.7 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  27.59 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  28.06 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  24.49 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  24.77 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 544 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  23.72 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.16 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 		 2240 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 4079 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4689  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 341 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0120  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 555 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 265 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 243 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  26.56 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.56 
 
 		 730 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  29.2 
 
 		 575 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1069 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0327  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 3560 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 884 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 		 784 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 711 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 643 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>