227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5906 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  100 
 
 
408 aa  830    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  44.92 
 
 
667 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  44.28 
 
 
664 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  37.82 
 
 
642 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36.64 
 
 
648 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  37.92 
 
 
647 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36.23 
 
 
647 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  35.57 
 
 
652 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  35.84 
 
 
647 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.1 
 
 
658 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.02 
 
 
598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.47 
 
 
595 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.67 
 
 
631 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.71 
 
 
738 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.13 
 
 
624 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.38 
 
 
629 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.13 
 
 
643 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.2 
 
 
588 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  45.29 
 
 
622 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.29 
 
 
634 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  44.12 
 
 
622 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  28.08 
 
 
603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  39.64 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 
626 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  36.55 
 
 
553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.64 
 
 
723 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  38.27 
 
 
317 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  38.55 
 
 
304 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.49 
 
 
568 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  35.54 
 
 
581 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  38.79 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.69 
 
 
568 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  40.31 
 
 
150 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 
597 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  31.85 
 
 
531 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  37.95 
 
 
306 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  25.29 
 
 
594 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  34.92 
 
 
502 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  29.66 
 
 
522 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 
327 aa  97.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.14 
 
 
596 aa  93.2  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  35.97 
 
 
515 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  31.16 
 
 
502 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  33.58 
 
 
510 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  33.33 
 
 
499 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.58 
 
 
746 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.41 
 
 
736 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.82 
 
 
737 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.25 
 
 
769 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  36.36 
 
 
525 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  31.34 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  30.28 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
1392 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  41.75 
 
 
308 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.89 
 
 
757 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  23.02 
 
 
686 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
580 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  29.86 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  27.66 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  40.62 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  31.75 
 
 
607 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  38.83 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  30.88 
 
 
605 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  39.58 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
644 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
584 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  34.65 
 
 
521 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  30.51 
 
 
521 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 
821 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 
375 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.5 
 
 
582 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  27.54 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 
275 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.31 
 
 
798 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  21.33 
 
 
784 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  37.61 
 
 
315 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  29.47 
 
 
460 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.47 
 
 
822 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.69 
 
 
611 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.7 
 
 
289 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  32.08 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 
479 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  31.41 
 
 
301 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.34 
 
 
354 aa  57  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  29.6 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  30.06 
 
 
1027 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  30.06 
 
 
1027 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 
270 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  30.06 
 
 
1027 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  29.88 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  32.88 
 
 
465 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.75 
 
 
584 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
665 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 
532 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  29.7 
 
 
531 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2990  putative adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.0157257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>