74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1673 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
355 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  73.11 
 
 
358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  37.31 
 
 
311 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  39.1 
 
 
689 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
690 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 
690 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.14 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.16 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.16 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.91 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  27.88 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  28.57 
 
 
397 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  33.23 
 
 
390 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.3 
 
 
368 aa  92.8  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  26.26 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  28.28 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.88 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  24.32 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  34.62 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  21.99 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  26.44 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  33.11 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1797  hypothetical protein  29.15 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  24.79 
 
 
506 aa  66.6  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.39 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5313  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.03 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  30.41 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  27.01 
 
 
416 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.92 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  28.68 
 
 
424 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  31.78 
 
 
425 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  29.92 
 
 
425 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1625  hypothetical protein  23.69 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2433  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.72 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3792  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)  27.76 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.92 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  33.02 
 
 
428 aa  52.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  33.02 
 
 
428 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  27.42 
 
 
550 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  31.19 
 
 
427 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  24.62 
 
 
413 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  26.79 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  27.72 
 
 
550 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  25.7 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.65 
 
 
376 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  26.2 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  30.19 
 
 
428 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.65 
 
 
376 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.62 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  25.08 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  27.34 
 
 
436 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  19.45 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  27.34 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  27.12 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  28.91 
 
 
407 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  25.52 
 
 
400 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1117  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like  27.86 
 
 
477 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.362089  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  22.8 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  22.65 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  30.48 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  30.31 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  25 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2686  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
567 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0893187  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  28.12 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  25.74 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  22.29 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  24.4 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  32 
 
 
386 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.89 
 
 
376 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  27.41 
 
 
437 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  28.46 
 
 
379 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  29.91 
 
 
374 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  22.33 
 
 
395 aa  42.7  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>