More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0741 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  49.36 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  47.37 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  49.68 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  43.5 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  45.86 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  43.5 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 		 332 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  47.74 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  48.63 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  48.63 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  43.66 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  44.37 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  45.06 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  43.2 
 
 		 339 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  46.05 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  45.52 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  44.65 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  41.77 
 
 		 314 aa  92.8  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  39.46 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  39.44 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  39.44 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  38.78 
 
 		 324 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  36.62 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  45.16 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  37.75 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  38.93 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  38.93 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  34.76 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  40.44 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  42.65 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  40.4 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  32.5 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  36.22 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  32.5 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  36.02 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  32.14 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  36.69 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  29.87 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  39.83 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  32.23 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  31.93 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  45.92 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  41.53 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  50.57 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  31.97 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3869  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  35.94 
 
 		 188 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>