More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0639 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0639  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01219  putative LysR-family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0949  transcriptional regulator, LysR family  49.13 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3502  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1350  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2825  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0726357  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3361  transcriptional regulator, LysR family  44.6 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1578  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1156  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3381  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3536  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246229  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1832  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2423  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3271  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0310  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1471  transcriptional regulator, LysR family  22.67 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4177  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 304 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0758  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1107  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33170  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.162388  hitchhiker  0.0024503 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  29.95 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2820  transcriptional regulator  24.65 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2773  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4434  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0053  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0050  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4138  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6757  transcriptional regulator, LysR family  20.75 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5763  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0160  transcription regulator protein  30.34 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1129  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1591  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.9 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2875  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3416  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2834  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3085  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  30.77 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  27.11 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1783  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6189  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2478  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.695229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0270  transcriptional regulator, LysR family  22.87 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1122  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6313  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  26.26 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.54 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6562  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  28.27 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6244  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235646  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3932  LysR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3940  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  36.73 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71750  LysR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5066  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  24.45 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0841  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.697299  normal  0.209982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0600  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5092  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3242  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3833  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4311  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  28.27 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6304  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.37 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1473  chromosome replication initiation inhibitor protein  24.44 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1856  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144419  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0613  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3744  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>