More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0625 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  100 
 
 		 466 aa  918    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  64.1 
 
 		 395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  54.24 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  48.54 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 293 aa  86.7  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  32.39 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  37.39 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  31.52 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  37.39 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.06 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  30.25 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  30.25 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  30.25 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  30.25 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  37.39 
 
 		 265 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  30.25 
 
 		 234 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  30.25 
 
 		 234 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  30.25 
 
 		 234 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  32.95 
 
 		 221 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  41.9 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  37.39 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  44.57 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  44 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  30.97 
 
 		 223 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  30.97 
 
 		 223 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  47.73 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  30.97 
 
 		 223 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  38.61 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  30.28 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  42.39 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  34.23 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  33.53 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  30.49 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  38.83 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  36.79 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  29.68 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  40 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  28.74 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.65 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  40 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  38.32 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.18 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  40 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  40 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  40 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  35.09 
 
 		 546 aa  73.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  39.39 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.68 
 
 		 327 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  39.58 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  30 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.81 
 
 		 321 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 234 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  28.17 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.57 
 
 		 270 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  36.52 
 
 		 265 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  37.39 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  37.39 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  37.39 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  40.57 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  37.39 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  37.39 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  44.94 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  29.38 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  41.56 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  39.83 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  38.74 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  31.25 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  34.84 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  37.37 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  38.83 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  31.95 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  39.78 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  31.25 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  31.25 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  31.25 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  31.25 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>