103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0270 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  100 
 
 
299 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  90.27 
 
 
299 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  90.27 
 
 
299 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1028  hypothetical protein  61.49 
 
 
297 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.58 
 
 
430 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  26.1 
 
 
620 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.97 
 
 
536 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  23.43 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.53 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  24.4 
 
 
413 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  24.34 
 
 
422 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  24.3 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0305  phospholipase D/transphosphatidylase  24.81 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  25.15 
 
 
550 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  32.58 
 
 
207 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  33.06 
 
 
223 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  32.58 
 
 
207 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  32.58 
 
 
207 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  32.58 
 
 
207 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  32.58 
 
 
207 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  32.58 
 
 
207 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.76 
 
 
586 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.62 
 
 
252 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  23.9 
 
 
392 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  23.24 
 
 
446 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.85 
 
 
611 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.12 
 
 
622 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.81 
 
 
366 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  28.37 
 
 
175 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.32 
 
 
484 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.62 
 
 
560 aa  52.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.81 
 
 
397 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.95 
 
 
397 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.79 
 
 
397 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  26.79 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  26.79 
 
 
397 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.27 
 
 
363 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.15 
 
 
397 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.15 
 
 
397 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  23.55 
 
 
559 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  29.6 
 
 
480 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  29.93 
 
 
196 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  29.55 
 
 
183 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  30.58 
 
 
223 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  31.4 
 
 
242 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  23.35 
 
 
476 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.06 
 
 
207 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  31.06 
 
 
207 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  23.81 
 
 
558 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  25.08 
 
 
482 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  31.06 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  30.4 
 
 
184 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  31.15 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.06 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  31.4 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  24.82 
 
 
470 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0490  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.97 
 
 
677 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  25 
 
 
476 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  23.53 
 
 
397 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  28.35 
 
 
483 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  28.35 
 
 
483 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.67 
 
 
219 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.21 
 
 
551 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  21.54 
 
 
484 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  30.3 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.34 
 
 
472 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.65 
 
 
472 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  26.16 
 
 
479 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  27.46 
 
 
485 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3264  cardiolipin synthetase domain protein  27.34 
 
 
377 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.415257  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
462 aa  45.8  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  24.51 
 
 
477 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  23.28 
 
 
472 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.38 
 
 
486 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2045  cardiolipin synthetase domain protein  27.34 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  27.15 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  25 
 
 
177 aa  44.7  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  28.69 
 
 
490 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  24.7 
 
 
478 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  27.61 
 
 
481 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  23.18 
 
 
556 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  25.41 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  27.27 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  34.09 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  23.38 
 
 
505 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  23.38 
 
 
505 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  32.03 
 
 
186 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  26.24 
 
 
441 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.1 
 
 
219 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  24.69 
 
 
500 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  23.66 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5469  cardiolipin synthetase domain protein  26.57 
 
 
397 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000646533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  27.2 
 
 
417 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  27.65 
 
 
475 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  28.39 
 
 
486 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  53.85 
 
 
189 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.5 
 
 
498 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>