More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1412 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1412  aminotransferase class V  100 
 
 		 391 aa  774    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1453  putative cysteine desulfurase  57.06 
 
 		 381 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.273415  hitchhiker  0.00591907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  48.9 
 
 		 378 aa  322  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1582  aminotransferase, class V  58.06 
 
 		 382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  45.69 
 
 		 400 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  49.61 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.33 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  43.72 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  42.08 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  43.62 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  43.16 
 
 		 393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  45.14 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  42.93 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  46.21 
 
 		 410 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  43.88 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.84 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1537  cysteine desulfurase  49.18 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.417733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1253  aminotransferase class V  49.18 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  42.29 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.93 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  47 
 
 		 388 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.68 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  46.88 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  40.26 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.54 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  44.53 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  41.64 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  42.56 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  40.84 
 
 		 402 aa  276  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  44.65 
 
 		 407 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  39.21 
 
 		 386 aa  275  8e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.58 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  42.08 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.31 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.58 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  41.76 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.05 
 
 		 1143 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  41.22 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  42.11 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  43.47 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  41.56 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  40.48 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  43.73 
 
 		 379 aa  269  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  38.96 
 
 		 384 aa  269  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  45.63 
 
 		 1139 aa  269  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.16 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0212  cysteine desulfurase  51.07 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.133802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  45.93 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  38.63 
 
 		 384 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.68 
 
 		 402 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  35.47 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.33 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  43.04 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  40.26 
 
 		 401 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  40.26 
 
 		 401 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  38.62 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  46.56 
 
 		 381 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  38.83 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  39.52 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  39.89 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.51 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  38.18 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  40 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  46.79 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  37.66 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.02 
 
 		 414 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  36.41 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  39.53 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  37.6 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.02 
 
 		 1135 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  35.26 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  38.12 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  38.65 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  42.93 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  41.51 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  36.6 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  38.54 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  37.6 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  35.34 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  37.6 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  36.22 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  46.03 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  43.09 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.22 
 
 		 393 aa  245  9e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  38.38 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  44.02 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  42.82 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  39.89 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1098  aminotransferase class V  46.3 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  38.9 
 
 		 380 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  41.14 
 
 		 395 aa  242  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>