33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0294 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 426 aa  790    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1868  O-antigen and teichoic acid-like export protein  31.58 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2377  polysaccharide biosynthesis protein  30.19 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.686073  normal  0.756992 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1563  polysaccharide biosynthesis protein  32.76 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1141  O-antigen translocase  26.01 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0202  polysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.153465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  26.03 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0587  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 495 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.294398  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1420  O-antigen translocase  24.39 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4759  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000435515  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1881  polysaccharide biosynthesis protein  35.91 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  25.62 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  24.07 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1863  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0564121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1930  polysaccharide biosynthesis protein  27.9 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0363  polysaccharide biosynthesis protein  31.27 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2973  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 538 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3125  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 419 aa  90.5  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1503  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2622  polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0388  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3022  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 466 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1137  porS protein  24.3 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3176  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  26.9 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  20.28 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4426  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0253481  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3556  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  21.23 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0588  putative capsular polysaccharide bisynthesis protein  22.6 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  27.01 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 480 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0454  membrane protein  24 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.47 
 
 		 508 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>