More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0359 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0359  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000171313  hitchhiker  0.000153008 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  59.43 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0906  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.98 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00296617  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0948  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0793673  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1666  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.47 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0577  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.21 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113585  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  46.67 
 
 		 246 aa  202  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  44.76 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  48.54 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  47.12 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  47.78 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  47.83 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.11 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.73 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.12 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  44.81 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  45.71 
 
 		 243 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  48.11 
 
 		 243 aa  197  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  47.34 
 
 		 242 aa  197  7.999999999999999e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  48.54 
 
 		 250 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 284 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  48.11 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.91 
 
 		 592 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.89 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  44.5 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0204  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.701946  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  46.7 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.54 
 
 		 246 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 240 aa  194  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  44.13 
 
 		 246 aa  194  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  46.12 
 
 		 253 aa  194  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  45.89 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  44.76 
 
 		 244 aa  194  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 		 244 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  45.89 
 
 		 242 aa  194  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  43.81 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  47.64 
 
 		 243 aa  193  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 		 240 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 240 aa  193  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 		 240 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  43.4 
 
 		 245 aa  193  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  45.45 
 
 		 252 aa  193  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  44.29 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 240 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  44.5 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  44.44 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  44.29 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  42.65 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  45.41 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.92 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 252 aa  191  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 252 aa  191  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 252 aa  191  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  44.98 
 
 		 244 aa  191  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  43.54 
 
 		 240 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  42.86 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  46.15 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  42.86 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  42.86 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  42.99 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  42.38 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  45.59 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  47.34 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  46.83 
 
 		 252 aa  190  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1165  ATPase  44.6 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  44.44 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  43.27 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  44.81 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.5 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  41.06 
 
 		 244 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  47.69 
 
 		 246 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0701  arginine transporter ATP-binding subunit  44.13 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  41.98 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  43.32 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  44.33 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  42.38 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  45.15 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  44.44 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>