129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A08 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008496  LEUM_A08  integrase  100 
 
 
195 aa  404  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  36.7 
 
 
186 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  33.15 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.15 
 
 
180 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  34.72 
 
 
186 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  34.27 
 
 
180 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  32.58 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  32.3 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.15 
 
 
180 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  31.46 
 
 
180 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  35.15 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  31.72 
 
 
182 aa  89  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  31.1 
 
 
190 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  31.1 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  31.1 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  29.84 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  32.4 
 
 
187 aa  84.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  30.48 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  31.91 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  31.25 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  30.77 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  29.21 
 
 
183 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  31.89 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  31.89 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  31.89 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  31.35 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  29.53 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  29.61 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  30.72 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  29.49 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.05 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  30.97 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  29.68 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  28.39 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  26.23 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  30.27 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  29.63 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  27.98 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  29.49 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.7 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  30.27 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  25.68 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  25.68 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  25.68 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  30.18 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  25.68 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  25.68 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  25.68 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  27.98 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  29.35 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  25.68 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  25.68 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  25.68 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  28.26 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  24.31 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  29.35 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  28.85 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  29.07 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.22 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.76 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  27.81 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  27.5 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  26.92 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  26.49 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  27.03 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  27.03 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  27.03 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  25.95 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  26.92 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  27.74 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  26.06 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  26.7 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  28.39 
 
 
238 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.67 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  27.98 
 
 
210 aa  61.6  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  25.95 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  29.8 
 
 
198 aa  61.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  46.67 
 
 
73 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  26.95 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  28.29 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  29.58 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  28.57 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  28.34 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  28.34 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  27.1 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  26.45 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  28.67 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  29.14 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  28.85 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  28.12 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  27.56 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2540  integrase family protein  23.5 
 
 
350 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  30.28 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  29.05 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  27.88 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  26.49 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  25.62 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  28.67 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  26 
 
 
163 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  27.5 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>