232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17350 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  100 
 
 		 322 aa  614  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  42.53 
 
 		 280 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  43.65 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12580  degV family protein  41.1 
 
 		 284 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  37.82 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6798  degV family protein  39.41 
 
 		 283 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2272  hypothetical protein  39.48 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  36.4 
 
 		 297 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1983  degV family protein  38.74 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1885  degV family protein  38.1 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3526  degV family protein  37.05 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3599  degV family protein  37.05 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3531  degV family protein  37.05 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.766898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  36.94 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3849  degV family protein  39.13 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  31.95 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  27.39 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3922  degV family protein  34.08 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3470  degV family protein  41.64 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.748591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  28.48 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.42 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.42 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  26.38 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2657  degV family protein  36.33 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.108706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  29.74 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  30.16 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3190  degV family protein  32.5 
 
 		 286 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  25.72 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12470  degV family protein  34.75 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.403372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  36.49 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  32.35 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  31.37 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  26.56 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.04 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  33.01 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  29.08 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  28.85 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  28.85 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  28.85 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  28.85 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  26.8 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  26.92 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  28.85 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  31.64 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  28.52 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  28.85 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  32.71 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  31.05 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  31.78 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  31.44 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28270  degV family protein  33.33 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  32.89 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  32.71 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  32.24 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  28.01 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  32.71 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  28.01 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  32.24 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  26.42 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  32.24 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  32.24 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  32.24 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  30.57 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12445  hypothetical protein  41.26 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  31.7 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  31.51 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  26.14 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  30.47 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  28.34 
 
 		 279 aa  106  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  37.85 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  27.36 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  30.77 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  28.34 
 
 		 279 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  24.76 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  28.52 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  24.76 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  26.88 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2804  degV family protein  32.26 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  27.6 
 
 		 280 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  28.2 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  25.99 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  28.87 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6052  degV family protein  34.63 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  27.6 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  29.91 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13260  degV family protein  43.08 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.46 
 
 		 280 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  29.24 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  33.65 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  23.94 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  33.06 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  26.3 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2233  degV family protein  36.04 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.956375  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  25.31 
 
 		 833 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  29.51 
 
 		 281 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  27.97 
 
 		 637 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.19 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  27.94 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  27.65 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  27.24 
 
 		 290 aa  92.4  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>