More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12880 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  100 
 
 
273 aa  514  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.94 
 
 
270 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.93 
 
 
272 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.93 
 
 
272 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.93 
 
 
272 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.37 
 
 
267 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.94 
 
 
268 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.17 
 
 
271 aa  260  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 
272 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.34 
 
 
272 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.79 
 
 
270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.78 
 
 
268 aa  258  7e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.09 
 
 
272 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.73 
 
 
271 aa  255  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.36 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.31 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.94 
 
 
273 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.41 
 
 
269 aa  251  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.77 
 
 
274 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.34 
 
 
272 aa  249  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  61.9 
 
 
260 aa  248  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.83 
 
 
269 aa  248  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.53 
 
 
275 aa  246  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.82 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.69 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.81 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.85 
 
 
270 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.47 
 
 
269 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.92 
 
 
317 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.79 
 
 
274 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.69 
 
 
269 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.75 
 
 
277 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.05 
 
 
287 aa  228  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.79 
 
 
268 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 
268 aa  225  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.16 
 
 
272 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
265 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
271 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.04 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.33 
 
 
268 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.13 
 
 
263 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 
266 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.57 
 
 
266 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.59 
 
 
273 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.41 
 
 
266 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.28 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.02 
 
 
259 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.53 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49 
 
 
265 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.15 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.49 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.39 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 
263 aa  195  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
259 aa  195  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
269 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.59 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
266 aa  194  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.28 
 
 
295 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
269 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.66 
 
 
265 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.96 
 
 
278 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.73 
 
 
266 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.22 
 
 
267 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
258 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.18 
 
 
278 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.92 
 
 
264 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.49 
 
 
265 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.47 
 
 
267 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.66 
 
 
271 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.96 
 
 
273 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.79 
 
 
266 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.24 
 
 
265 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.05 
 
 
270 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.02 
 
 
262 aa  191  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.61 
 
 
266 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.72 
 
 
267 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.96 
 
 
263 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.4 
 
 
262 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.72 
 
 
285 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
267 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.77 
 
 
271 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.47 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.18 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.24 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.06 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.03 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.4 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41 
 
 
266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.97 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.22 
 
 
258 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.38 
 
 
276 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.22 
 
 
258 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.18 
 
 
265 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  40.77 
 
 
261 aa  189  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.92 
 
 
278 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.67 
 
 
277 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.52 
 
 
262 aa  188  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>