245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  100 
 
 		 553 aa  1095    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  49.45 
 
 		 547 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  50.19 
 
 		 547 aa  483  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  51.1 
 
 		 520 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  48.43 
 
 		 502 aa  467  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  48.62 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  49.3 
 
 		 524 aa  455  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  45.98 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  49.69 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  45.51 
 
 		 517 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  45.9 
 
 		 506 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  45.03 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  45.22 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  45.22 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  45.03 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  44.83 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  45.03 
 
 		 508 aa  432  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  45.03 
 
 		 508 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  45.03 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  45.03 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  44.83 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  44.83 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  40.94 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  39.71 
 
 		 492 aa  362  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  38.71 
 
 		 488 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  38.55 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  38.45 
 
 		 510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  40.95 
 
 		 497 aa  327  5e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  38.63 
 
 		 486 aa  327  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  36.85 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 527 aa  322  8e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  36.09 
 
 		 488 aa  317  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  38.18 
 
 		 493 aa  317  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  37.42 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  35.71 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  35.95 
 
 		 498 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  36.11 
 
 		 503 aa  300  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  35.48 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  35.94 
 
 		 503 aa  297  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  35.71 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  36.2 
 
 		 494 aa  282  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  35.5 
 
 		 499 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  32.16 
 
 		 498 aa  262  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  35.78 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  32.7 
 
 		 476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.05 
 
 		 452 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.9 
 
 		 456 aa  179  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  32.55 
 
 		 454 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  34.15 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  31.93 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  31.61 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  36.61 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  35.77 
 
 		 464 aa  171  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08966  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 		 675 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.48 
 
 		 468 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.68 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.08 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.37 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.37 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  32.37 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  31.74 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.08 
 
 		 446 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  31.79 
 
 		 446 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.44 
 
 		 455 aa  163  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.08 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  31.66 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  31.82 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  31.79 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  31.79 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  32.24 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  35.29 
 
 		 443 aa  161  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  29.89 
 
 		 461 aa  161  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  30.55 
 
 		 483 aa  160  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 		 459 aa  160  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  29.43 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  30.56 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  30.89 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  35.41 
 
 		 443 aa  157  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  30.2 
 
 		 448 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  30.83 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.07 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  30.1 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  30.79 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 451 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  29.69 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  32.78 
 
 		 437 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  30.81 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  34.92 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  35.18 
 
 		 455 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  29.21 
 
 		 458 aa  154  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  27.61 
 
 		 454 aa  153  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  26.77 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  32.05 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  29.29 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  35.33 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  30.43 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  30.77 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  32.76 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  32.76 
 
 		 452 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>