More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06240 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  100 
 
 		 438 aa  848    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  42.86 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  34.87 
 
 		 458 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 401 aa  169  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.29 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.42 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  41.41 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 		 386 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  39.38 
 
 		 425 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.75 
 
 		 419 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.66 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  38.46 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  39.83 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.33 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.92 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 422 aa  126  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  41.97 
 
 		 375 aa  126  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  39.7 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 373 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.45 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  40.59 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  34.6 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  36.16 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.2 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  40.91 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  45.33 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.58 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  41.3 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  34.48 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 420 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.61 
 
 		 408 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 428 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  38.66 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  38.25 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 536 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  36.56 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.3 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  39.82 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.98 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.99 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.98 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.63 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.21 
 
 		 421 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.96 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  37.02 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  36.96 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  42.31 
 
 		 555 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  38.31 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  35.94 
 
 		 399 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.72 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  34.57 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  39.64 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  31.7 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.61 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.42 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 394 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 383 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.45 
 
 		 438 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  39.71 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.04 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  38.1 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  37.67 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  34.72 
 
 		 401 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  37.56 
 
 		 383 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 484 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 403 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  36.7 
 
 		 445 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0270  signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 410 aa  96.3  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.13 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  33.72 
 
 		 379 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 496 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000683339  hitchhiker  0.000292513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.31 
 
 		 430 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  39.1 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  35.71 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.55 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 404 aa  94.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2538  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  36.54 
 
 		 372 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  38.12 
 
 		 426 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  35.1 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>