More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02620 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02620  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  100 
 
 		 382 aa  748    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1775  putative transcriptional regulator, GntR family  40.27 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000003497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0424  putative transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4327  putative transcriptional regulator, GntR family  38.4 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 402 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  32.52 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  35.83 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  31.04 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  33.24 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  32.94 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 395 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.39 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  29.23 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 395 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  33.78 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 		 424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 377 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.25 
 
 		 489 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 395 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0992  putative transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321451  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  31.81 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0003  putative transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  32.46 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 396 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  34.93 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  31.27 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 416 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  31.87 
 
 		 406 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  31.35 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 521 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.25 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  32.77 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06472  aminotransferase  30.77 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1763  aminotransferase, class I and II  31.45 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  32.77 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  32.77 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  32.77 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  32.77 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  32.77 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  32.77 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2449  putative 2-aminoadipate transaminase  31.22 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 468 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  26.7 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 611 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2148  aminotransferase, class I and II  30.43 
 
 		 386 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  31.62 
 
 		 436 aa  135  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2126  aminotransferase, class I and II  30.43 
 
 		 386 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.375573  normal  0.0326129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 395 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 438 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  32.5 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  31.04 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2997  aminotransferase, class I  31.51 
 
 		 452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.845231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1887  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 438 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  28.69 
 
 		 404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  30.32 
 
 		 439 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  24.8 
 
 		 396 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  32.21 
 
 		 393 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  30.57 
 
 		 420 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0291  putative transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 363 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  26.93 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.67 
 
 		 494 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000612  transcriptional regulator GntR family/aspartate aminotransferase  30.22 
 
 		 382 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.379678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 476 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 393 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>