More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1887 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1887  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
402 aa  822    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  37.66 
 
 
417 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 
463 aa  259  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.76 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  35.29 
 
 
398 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
340 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  34.95 
 
 
393 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
398 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
383 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  32.26 
 
 
433 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  34.95 
 
 
393 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
393 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  34.95 
 
 
393 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  34.78 
 
 
399 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
399 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
395 aa  238  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
393 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  34.69 
 
 
393 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  34.44 
 
 
393 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
393 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  35.7 
 
 
377 aa  235  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.46 
 
 
406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
395 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.1 
 
 
433 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 
396 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 
401 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 
396 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
399 aa  231  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  33.93 
 
 
393 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  33.08 
 
 
446 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  31.99 
 
 
397 aa  229  6e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
395 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  35.13 
 
 
435 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
410 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  34.46 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
397 aa  226  7e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
413 aa  226  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
386 aa  225  8e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 
432 aa  225  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 
438 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.4 
 
 
436 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  33.25 
 
 
410 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  33.25 
 
 
410 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  32.23 
 
 
416 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 
394 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 
394 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  33.85 
 
 
390 aa  222  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
414 aa  222  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  32.45 
 
 
420 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  32.43 
 
 
400 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 
611 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  31.47 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  31.46 
 
 
439 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 
398 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  33.67 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 
401 aa  219  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  33.67 
 
 
393 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  33.67 
 
 
393 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  33.67 
 
 
393 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 
436 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  33.67 
 
 
393 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  33.67 
 
 
393 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
409 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  31.99 
 
 
438 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  35.49 
 
 
394 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
405 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 
425 aa  216  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
406 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  35.71 
 
 
407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
398 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
437 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  34.34 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 
411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  34.09 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
388 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
408 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  34.12 
 
 
399 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  31.62 
 
 
398 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
450 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 
406 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  29.52 
 
 
440 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.88 
 
 
517 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  32.53 
 
 
406 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  30.98 
 
 
397 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  31.63 
 
 
437 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
397 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
405 aa  209  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>