77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1862 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  100 
 
 		 351 aa  695    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  49.08 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  45.72 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  48.52 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  48.52 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  48.52 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  47.4 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  47.94 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  44.58 
 
 		 546 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  41.08 
 
 		 320 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  34.99 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  38.71 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  36.12 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  35.21 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  25.37 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  24.82 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  24.82 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  25.35 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  23.74 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  28.41 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  25.5 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  22.82 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  20 
 
 		 357 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  22.5 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  21.4 
 
 		 366 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  21.01 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  29.48 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  21.01 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  21.01 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  26.71 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  26.57 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  21.01 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  21.01 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  21.01 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  21.01 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  21.4 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  21.01 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  21.01 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  28.43 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  18.18 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  23.55 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  23.53 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  30.14 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  26.2 
 
 		 446 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.14 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  28.1 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.01 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  34.09 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  31.17 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  27.92 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  29.68 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  20.98 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  22.99 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  29.27 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  18.47 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  22.85 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  18.12 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  32.12 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  18.12 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  18.12 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  18.12 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  28.19 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  26.26 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  24.07 
 
 		 538 aa  43.9  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.73 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  23.92 
 
 		 499 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  22.99 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  25.5 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.67 
 
 		 525 aa  43.5  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  27.15 
 
 		 311 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 445 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  32.31 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  27.15 
 
 		 424 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  26.57 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  25.67 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>