More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1405 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  100 
 
 		 262 aa  504  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  54.89 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  60.09 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  52.89 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  52.99 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  56.19 
 
 		 244 aa  208  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  59.73 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  56.71 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  58.26 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  58.26 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  46.9 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  44.24 
 
 		 198 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  45.45 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  44.34 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  43.18 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  43.35 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  43.35 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  42.65 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  38.43 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  38.99 
 
 		 206 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  42.18 
 
 		 198 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  42.06 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  43.84 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  41.09 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  38.65 
 
 		 212 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  43.07 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  38.65 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  39.61 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 199 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  41.78 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  40.67 
 
 		 206 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  44.06 
 
 		 198 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  41.71 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  36.7 
 
 		 210 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  42.18 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  41.9 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  41.23 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  37.25 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  40.39 
 
 		 235 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  43.89 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  40.39 
 
 		 198 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  42.99 
 
 		 210 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  39.91 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  38.12 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  40.28 
 
 		 198 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  33.64 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  41.55 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  41.4 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  39.46 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  38.28 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  41.23 
 
 		 198 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  37.14 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  37.86 
 
 		 190 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  43.69 
 
 		 215 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 191 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  37.78 
 
 		 227 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 191 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  37.65 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  40.64 
 
 		 206 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  42.93 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  35.16 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  39.25 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  33.64 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  32.41 
 
 		 206 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  36.89 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1850  RNase HII  42.86 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  38.57 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  39.25 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 201 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  39.27 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  39.25 
 
 		 198 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 201 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  40.49 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  37.07 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  33.98 
 
 		 203 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  37.44 
 
 		 193 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  33.8 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  39.22 
 
 		 202 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  36.77 
 
 		 224 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  38.03 
 
 		 214 aa  122  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>