More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1024 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  741    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 432 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  37.25 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  33.61 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  36.16 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  36 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  35.88 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  36 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 406 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  35.88 
 
 		 391 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  35.26 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  38.19 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  36.89 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  33.24 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  34.55 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  37.91 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  36.88 
 
 		 447 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  37.86 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  39.17 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  39.17 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 396 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 388 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  33.63 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 391 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  36.67 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  27.91 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  33.14 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  31.99 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 392 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 385 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  36.57 
 
 		 399 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  35.24 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  34.76 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  35.24 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  35.24 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  35.24 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  38.01 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  30.77 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  28.02 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  30.61 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  29.92 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.61 
 
 		 404 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 412 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  30.9 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  35.97 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  31.3 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>