232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0886 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  56.34 
 
 		 267 aa  308  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  54.68 
 
 		 262 aa  292  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  50.18 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  47.17 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  46.44 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  46.52 
 
 		 265 aa  221  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  45.26 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  47.17 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  46.39 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  45.83 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  44.15 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  43.07 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  43.54 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  44.03 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  43.66 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  43.45 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  42.32 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  41.25 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  42.26 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  41.47 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  41.47 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  41.47 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  41.76 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  41.64 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  42.32 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  41.13 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 		 251 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  38.38 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.51 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  30.07 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  33.45 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  29.43 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  29.06 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  29.06 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  29.06 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  29.06 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  29.06 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  28.3 
 
 		 244 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  28.68 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 240 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  26.42 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  32.9 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  27.96 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  26.97 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  26.73 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  25.16 
 
 		 312 aa  72  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  23.24 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  25.88 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.56 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  22.54 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  22.54 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  23.08 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1128  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  22.89 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.59 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  23.6 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  23.67 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  22.58 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  25.08 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  25.64 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  30.53 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>