95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3797 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3797  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  100 
 
 		 316 aa  630  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0342  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.55 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2672  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.99 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0519084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.11 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.671044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0177  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.54 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.25 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.89 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  26.89 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2072  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.29 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.23 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003379  immunogenic protein  21.67 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.74 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06717  hypothetical protein  26.69 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000812  immunogenic protein  25.66 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4560  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.68 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3688  hypothetical protein  25.27 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.269569 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2878  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.36 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.082119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02419  hypothetical protein  22.92 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0645  TRAP-type uncharacterized transport system  26.98 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3566  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  23.84 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.28304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.22 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  26.17 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.17 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0468  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.09 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.33 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0314  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  21.12 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.889469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2004  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  20.95 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1040  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.7 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.58 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1853  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.62 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.45766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1256  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2942  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.86 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3839  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.15 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0135422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4067  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.36 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.548232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1537  hypothetical protein  24.5 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0356  hypothetical protein  22.31 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.097907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2848  immunogenic protein  20.85 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2365  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.02 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1635  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.1 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00793  hypothetical protein  21.7 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3723  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.78 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1090  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.52 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0945459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.32 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4446  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.31 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1133  immunogenic protein  26.64 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6347  hypothetical protein  21 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1880  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.94 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.460702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  21.38 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4160  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.08 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3009  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.96 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.582062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2949  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.01 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.09 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0033  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  21.12 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3901  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.09 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4024  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.09 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0433  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.09 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3828  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  21.09 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4400  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.5 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478919  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.59 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2692  immunogenic protein family protein  23.2 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3381  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.55 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73120  hypothetical protein  21.12 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1346  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  19.08 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.331988  hitchhiker  0.00000684502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0874  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.78 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0725  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  21.73 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  23.21 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3568  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  20.61 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0137  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.63 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0457  response regulator receiver protein  20.61 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0358  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.2 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0105489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3623  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.83 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.410742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4226  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.63 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0963703  normal  0.823727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0461  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  20.27 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1443  TRAP transporter solute receptor  25.3 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.552427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0777  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.32 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3267  hypothetical protein  22.68 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  20.82 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0640  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  20.08 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0456  immunogenic-related protein  21.21 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.22 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6519  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.22 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6753  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.22 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0691662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0619  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.46 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4417  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.58 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0674202 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0114  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.57 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0431  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.33 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4036  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.13 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2329  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.89 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.809783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7503  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, aliphatic sulphonates  31.13 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0237  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.9 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0860272  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1613  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  22.41 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0267  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.41 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  19.93 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.81 
 
 		 651 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>