More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5753 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  100 
 
 		 369 aa  743    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 335 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  29.82 
 
 		 687 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  32.03 
 
 		 313 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  35.34 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  29.56 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  29.56 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  29.97 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  29.5 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  34.72 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  29.07 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  29.23 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  29.47 
 
 		 323 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  29.96 
 
 		 683 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.12 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  31.76 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  33.19 
 
 		 352 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.86 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  23.72 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  31 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  28.79 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  29.37 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  29.07 
 
 		 335 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  30.43 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  29.13 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  31.11 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.05 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  26.15 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  28.86 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  27.05 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  29.46 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  30.34 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.47 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  29.92 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  29.66 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.43 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  28.85 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  25.36 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  25.36 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  27.9 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.17 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  31.3 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  28.52 
 
 		 675 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  26.04 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  34.56 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  29.27 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  25.5 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.26 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  25.58 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  26.36 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  29.39 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  26.92 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.66 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.71 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.75 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  24.56 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.94 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  31.82 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.67 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  24.56 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  46.58 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  24.34 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.03 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  30.17 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  27.65 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.14 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  38.37 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  29.02 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  33.53 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.05 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  30.43 
 
 		 232 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.78 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  27.31 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.19 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.9 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  30.3 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3432  helix-turn-helix, type 11  30.69 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  30.67 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  28.4 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.29 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.58 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.76 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  24.71 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  24.71 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  24.71 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3551  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.57 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  36.05 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.18 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.68 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.11 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  26.9 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7257  helix-turn-helix type 11 domain protein  26.99 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  24.56 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>