More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4344 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  100 
 
 
323 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
415 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  41.74 
 
 
124 aa  99.4  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  40.87 
 
 
124 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.52 
 
 
388 aa  86.3  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  33.9 
 
 
123 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  41.53 
 
 
130 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  42.73 
 
 
126 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  41.59 
 
 
120 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.28 
 
 
389 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.5 
 
 
480 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  41.44 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  39.13 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  41.88 
 
 
119 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  33.05 
 
 
123 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.45 
 
 
123 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  37.9 
 
 
119 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  41.07 
 
 
116 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  38.39 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 
119 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  37.1 
 
 
119 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  37.72 
 
 
119 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  35.07 
 
 
140 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.66 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 
119 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  40.17 
 
 
119 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
393 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  39.84 
 
 
161 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  40.17 
 
 
119 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  40.17 
 
 
119 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  40.17 
 
 
119 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  34.65 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.91 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  35.77 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 
124 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  39.33 
 
 
99 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  38.2 
 
 
99 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  37.6 
 
 
128 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  37.6 
 
 
128 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.79 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  40.52 
 
 
130 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
128 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  36.94 
 
 
119 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  38.79 
 
 
119 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  35.25 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 
129 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 
130 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  33.86 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  40.48 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.15 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  38.83 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  36.29 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  38.98 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
136 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.16 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.45 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  32.52 
 
 
159 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
158 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  44.09 
 
 
140 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  34.4 
 
 
153 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  28.36 
 
 
134 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 
136 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  34.15 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30.7 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  34.65 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.19 
 
 
471 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  34.11 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  33.07 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.67 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.29 
 
 
379 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  36.47 
 
 
117 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36 
 
 
141 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  29.27 
 
 
140 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 
123 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 
137 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.29 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  30.89 
 
 
140 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 
141 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
392 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
129 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
113 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  33.9 
 
 
130 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0894  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
275 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  40.86 
 
 
151 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
269 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
237 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
237 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
274 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
237 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>