More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3665 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  38.7 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  37.68 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  34.76 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  44.09 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  28.7 
 
 		 275 aa  98.6  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  34.43 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  33.03 
 
 		 589 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  42.06 
 
 		 593 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 589 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  27.1 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  32.56 
 
 		 610 aa  79  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  29 
 
 		 606 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  39.67 
 
 		 641 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  31.31 
 
 		 592 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  31.28 
 
 		 589 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  29.75 
 
 		 574 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  29.91 
 
 		 587 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  36.52 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  27.5 
 
 		 565 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  38.05 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  29.39 
 
 		 602 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  30.41 
 
 		 594 aa  68.6  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  24.51 
 
 		 697 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  28.28 
 
 		 723 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  27.63 
 
 		 581 aa  65.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  26.91 
 
 		 616 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  25.49 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  30.23 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  40.43 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  40.43 
 
 		 687 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  40.43 
 
 		 687 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  40.43 
 
 		 687 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  30.83 
 
 		 617 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 		 596 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  30.23 
 
 		 886 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  32.03 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  33.8 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  26.46 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  24.8 
 
 		 598 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  25.23 
 
 		 618 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  41.67 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  30.89 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  28.5 
 
 		 599 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 		 756 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  35.64 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 774 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  37.84 
 
 		 730 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  32.81 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  25.45 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 907 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 		 572 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 748 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  24.77 
 
 		 694 aa  58.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  34.62 
 
 		 613 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  37.5 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  22.51 
 
 		 1017 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 794 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 		 734 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 		 661 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  32.79 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  34.19 
 
 		 646 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  27.15 
 
 		 604 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  37.84 
 
 		 754 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 		 734 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 		 757 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1781  hypothetical protein  28.98 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  36.49 
 
 		 1095 aa  55.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 975 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  24.56 
 
 		 595 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  31.25 
 
 		 735 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 		 612 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  30.36 
 
 		 769 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  30.4 
 
 		 843 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 734 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 734 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 734 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 734 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  30.4 
 
 		 642 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 731 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  37.84 
 
 		 796 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 734 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 734 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  34.62 
 
 		 785 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  35.14 
 
 		 792 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  33.94 
 
 		 771 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 		 687 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  36.49 
 
 		 731 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>