More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2195 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2195  peptide deformylase  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.370127  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  47.02 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  47.62 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  47.02 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  43.37 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  44.05 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  45.24 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  44.05 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  42.17 
 
 		 167 aa  150  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  45.24 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  43.37 
 
 		 181 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  41.71 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  42.17 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  42.77 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  42.17 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  43.45 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  44.91 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  44.64 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.51 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.51 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  41.32 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  43.37 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  43.71 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  43.11 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  40.96 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  43.45 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  40.96 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  41.52 
 
 		 171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  41.92 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  43.11 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  42.77 
 
 		 179 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  42.17 
 
 		 175 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  40.96 
 
 		 175 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  42.77 
 
 		 216 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  40.35 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  41.92 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  43.9 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  42.77 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  42.77 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  43.9 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  42.26 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  42.17 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  46.5 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  42.86 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  42.44 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  42.17 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  40.8 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  40.8 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  39.76 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  41.04 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0833  peptide deformylase  42.86 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  43.48 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  40.85 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  40.96 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  40.36 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  40.72 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  45.18 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  41.82 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  37.43 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  42.7 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  45.18 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  39.77 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  41.18 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  46.39 
 
 		 167 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  40.72 
 
 		 169 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  39.88 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  40.35 
 
 		 169 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  42.35 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  39.88 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  41.32 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  42.77 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  42.77 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  42.77 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  42.77 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  40 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  43.11 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  40.24 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  41.57 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  39.46 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  42.77 
 
 		 173 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  41.57 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  38.6 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.37 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.37 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  42.17 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  40.96 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  41.57 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  41.57 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>