105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1448 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.06 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  25.87 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  25.25 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  26.79 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  23.33 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  23.47 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  23.47 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  23.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  23.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  23.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  40 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  26.19 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  28 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  39.13 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  25.99 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.8 
 
 		 345 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  34.51 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 		 357 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.09 
 
 		 366 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  31.86 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 		 315 aa  48.5  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.92 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  33.6 
 
 		 293 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  28.1 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  27.88 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  28.29 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.57 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 		 375 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 		 373 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 324 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 372 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  25.57 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 372 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 372 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 326 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  35.4 
 
 		 292 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  33.05 
 
 		 297 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  34.07 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 		 308 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  25.83 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 295 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  34.21 
 
 		 256 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 318 aa  45.1  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  27.33 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  38.96 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  28.36 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 		 340 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 		 326 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  32.61 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 450 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 342 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  32.08 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.67 
 
 		 491 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 326 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  33.65 
 
 		 334 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  25.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  29.63 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 340 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  31.93 
 
 		 349 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  31.06 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 		 321 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 314 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 		 342 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  33.62 
 
 		 305 aa  42.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  33.33 
 
 		 279 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.33 
 
 		 491 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 335 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.837895  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  27.64 
 
 		 246 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  29.91 
 
 		 274 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 327 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 316 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.43 
 
 		 336 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.14 
 
 		 326 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 305 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.97 
 
 		 500 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.76 
 
 		 296 aa  41.6  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  32.18 
 
 		 340 aa  41.6  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 312 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 289 aa  41.2  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  23.56 
 
 		 251 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>