251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4624 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  100 
 
 		 251 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  98.01 
 
 		 251 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  98.01 
 
 		 251 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.05 
 
 		 251 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  72.43 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  63.67 
 
 		 267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  67.08 
 
 		 251 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  62.14 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  60.08 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  58.23 
 
 		 254 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  60 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  59.27 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  59.26 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  56.68 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  57.09 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  57.26 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  59.11 
 
 		 255 aa  268  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.2 
 
 		 254 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  57.49 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  55.69 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  55.06 
 
 		 247 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  54.58 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  54.92 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  53.39 
 
 		 250 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  57.72 
 
 		 402 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  53.44 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  53.91 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  50.2 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  51.42 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  51.42 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.98 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  56.45 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  56.73 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  56.73 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  56.73 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  47.77 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.61 
 
 		 258 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.21 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.88 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  56.07 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  48.99 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  54.7 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  49.58 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.42 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  42.28 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  47.13 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  45.49 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  40.49 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  39.36 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  56.72 
 
 		 137 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  42.28 
 
 		 246 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  38.71 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  38.78 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.29 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  38.17 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  36.73 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  38.11 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  37.7 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.03 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.47 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  33.07 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.58 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.28 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  33.78 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.03 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  29.77 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  32.88 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  29.63 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  29.92 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 		 295 aa  72  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  29.28 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  29.29 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  27.78 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  31.02 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  29.22 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  29.59 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 306 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  24.24 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  29.09 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>