More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1308 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  100 
 
 		 382 aa  781    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  30.59 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.8 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  26.54 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  26.76 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  30 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  29.22 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.9 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  27.32 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  26.52 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  25.53 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.03 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.72 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.18 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  25.57 
 
 		 411 aa  90.5  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  26.17 
 
 		 393 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  25.84 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  24.1 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  22.92 
 
 		 404 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  24.17 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  24.49 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  24.46 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.26 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  26.13 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.72 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.72 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.87 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.87 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  26.5 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  26.9 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  23.4 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  24.2 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  23.71 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  21.67 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  26.65 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  25.24 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  24.66 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  22.61 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  23.87 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.17 
 
 		 885 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.38 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  22 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  22.96 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  24.26 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  23.16 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  22.76 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  26.32 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.13 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  27.13 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  23.18 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  23.57 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.61 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  24.32 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  21.19 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  21.19 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  21.19 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.41 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  23.66 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  29.03 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  22.36 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  22.6 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  24.04 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  20.93 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  20.93 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  20.67 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  20.67 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  20.67 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  24.78 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  26.92 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  25.56 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  21.66 
 
 		 469 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.98 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  22.98 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.22 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  23.35 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  25.58 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  22.3 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  26.58 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  25.12 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.68 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  25.41 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  20.76 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  22.81 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  22.45 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  22.03 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  25.13 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.63 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  22.03 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.39 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  19.71 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  25.07 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  26.86 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.88 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  22.15 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.86 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  25.92 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  25.61 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>