More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3039 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3039  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
267 aa  510  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0932911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.54 
 
 
262 aa  338  7e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1169  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.81 
 
 
261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1271  Indole-3-glycerol phosphate synthase  67.8 
 
 
269 aa  314  9e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2818  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.32 
 
 
289 aa  300  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0914  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.03 
 
 
274 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.22 
 
 
274 aa  158  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3621  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.81 
 
 
268 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.78 
 
 
270 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.52 
 
 
268 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1543  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
248 aa  155  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1788  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.33 
 
 
252 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.75 
 
 
267 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.26 
 
 
270 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.57 
 
 
286 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.29 
 
 
269 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1685  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.28 
 
 
250 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.159562  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.05 
 
 
273 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.06 
 
 
271 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
278 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.53 
 
 
287 aa  148  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.28 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.71 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0107  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.59 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.34 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.51 
 
 
317 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.47 
 
 
269 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.02 
 
 
288 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
268 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.95 
 
 
270 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.05 
 
 
272 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.92 
 
 
258 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.81 
 
 
262 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 
269 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.09 
 
 
268 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.05 
 
 
269 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.92 
 
 
258 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.1 
 
 
287 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.74 
 
 
271 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.45 
 
 
258 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.39 
 
 
272 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.22 
 
 
259 aa  142  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.57 
 
 
274 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.24 
 
 
269 aa  141  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.74 
 
 
260 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.94 
 
 
266 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.32 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.34 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.34 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.68 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.43 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.34 
 
 
259 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.27 
 
 
251 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.44 
 
 
270 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.38 
 
 
285 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.61 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.8 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.03 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.5 
 
 
266 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.16 
 
 
285 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.9 
 
 
272 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.9 
 
 
272 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.9 
 
 
272 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41 
 
 
266 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.63 
 
 
267 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.57 
 
 
266 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.84 
 
 
282 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.09 
 
 
262 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.34 
 
 
264 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.96 
 
 
272 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.39 
 
 
273 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2094  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.51 
 
 
255 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.89 
 
 
264 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.78 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
269 aa  136  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.64 
 
 
267 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.55 
 
 
271 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
265 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.52 
 
 
265 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.96 
 
 
257 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
272 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.15 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.66 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.52 
 
 
285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.39 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.52 
 
 
285 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.79 
 
 
266 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.18 
 
 
263 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
268 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
256 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.28 
 
 
258 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.18 
 
 
263 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.99 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.39 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.44 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>