More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1685 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1685  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
250 aa  500  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.159562  normal  0.0633733 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1876  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.08 
 
 
248 aa  295  6e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.51 
 
 
258 aa  178  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.37 
 
 
262 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
262 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.47 
 
 
263 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.55 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
275 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1271  Indole-3-glycerol phosphate synthase  41.49 
 
 
269 aa  161  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.19 
 
 
267 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.65 
 
 
261 aa  159  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 
286 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.06 
 
 
260 aa  158  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.5 
 
 
259 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.6 
 
 
260 aa  155  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.04 
 
 
270 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.54 
 
 
271 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.81 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.3 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.61 
 
 
269 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.66 
 
 
266 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.56 
 
 
265 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.78 
 
 
269 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.18 
 
 
269 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.35 
 
 
268 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.87 
 
 
256 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.91 
 
 
263 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.65 
 
 
260 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3039  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.28 
 
 
267 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0932911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.63 
 
 
269 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.1 
 
 
272 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.23 
 
 
270 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0914  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.61 
 
 
258 aa  149  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.57 
 
 
272 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.58 
 
 
273 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.55 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.72 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.18 
 
 
267 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
271 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2818  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
289 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.64 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.64 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.64 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.59 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.12 
 
 
282 aa  144  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.65 
 
 
274 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3621  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.17 
 
 
268 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.89 
 
 
269 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.52 
 
 
269 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.3 
 
 
265 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.15 
 
 
272 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.93 
 
 
274 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1431  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.11 
 
 
260 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.11 
 
 
260 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.17 
 
 
259 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 
287 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1169  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.21 
 
 
261 aa  142  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  40 
 
 
270 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 
274 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.81 
 
 
266 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.43 
 
 
268 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.17 
 
 
268 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.73 
 
 
295 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.25 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.27 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.75 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.98 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.67 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.16 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.86 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.57 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.95 
 
 
267 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.71 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
257 aa  139  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.07 
 
 
271 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.18 
 
 
295 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.25 
 
 
263 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.25 
 
 
263 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.67 
 
 
269 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.42 
 
 
293 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.25 
 
 
260 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.42 
 
 
293 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.5 
 
 
267 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.09 
 
 
258 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.97 
 
 
265 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.1 
 
 
271 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
262 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.39 
 
 
258 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.82 
 
 
263 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.1 
 
 
269 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.99 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.41 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.96 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.23 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.09 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  37.64 
 
 
259 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1115  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.56 
 
 
228 aa  135  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.69 
 
 
262 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>