More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1543 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1543  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
248 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3621  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.94 
 
 
268 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0107  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.63 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.5 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2818  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
289 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1271  Indole-3-glycerol phosphate synthase  41.53 
 
 
269 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3039  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
267 aa  155  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0932911 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1169  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.77 
 
 
261 aa  152  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2094  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.06 
 
 
255 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
251 aa  142  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1396  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.56 
 
 
255 aa  141  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000419761  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.25 
 
 
268 aa  141  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.59 
 
 
274 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.17 
 
 
266 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.71 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.43 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.18 
 
 
275 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.91 
 
 
266 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 
272 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.92 
 
 
274 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.41 
 
 
271 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1147  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.51 
 
 
253 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.17 
 
 
273 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.93 
 
 
286 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.12 
 
 
267 aa  135  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.83 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.63 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.96 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1198  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.8 
 
 
255 aa  135  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.69 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1133  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.1 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1319  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.69 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000247169 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.69 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.449092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1396  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.1 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.17 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1876  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.06 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.29 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.69 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.59 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.79 
 
 
270 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.77 
 
 
274 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.58 
 
 
269 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.71 
 
 
266 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.17 
 
 
267 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.46 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.82 
 
 
268 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
272 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.9 
 
 
267 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
272 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
272 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 
258 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.93 
 
 
272 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4050  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.88 
 
 
253 aa  131  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.39 
 
 
269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.36 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1294  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.29 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2155  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.88 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.209706 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.89 
 
 
275 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.75 
 
 
268 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.79 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.71 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.73 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1685  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.55 
 
 
250 aa  129  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.159562  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.61 
 
 
258 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.61 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.61 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.08 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.44 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.6 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.05 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  39.62 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.71 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.83 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.41 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.91 
 
 
258 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.35 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.6 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.55 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.35 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.16 
 
 
259 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1788  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.94 
 
 
252 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0225  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.42 
 
 
251 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
270 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.56 
 
 
276 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0216  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.87 
 
 
267 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.17 
 
 
264 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.86 
 
 
259 aa  124  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.5 
 
 
273 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
263 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.44 
 
 
261 aa  123  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1359  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.29 
 
 
253 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.7 
 
 
268 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.59 
 
 
287 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.81 
 
 
282 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.93 
 
 
271 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.62 
 
 
260 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.86 
 
 
257 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>