More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0216 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0216  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
267 aa  530  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0225  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.39 
 
 
251 aa  245  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.78 
 
 
251 aa  239  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1788  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.25 
 
 
252 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1396  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.48 
 
 
255 aa  191  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000419761  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.61 
 
 
260 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3621  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.69 
 
 
268 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.71 
 
 
260 aa  155  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.66 
 
 
263 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.55 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1115  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
228 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 
270 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.37 
 
 
268 aa  148  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1271  Indole-3-glycerol phosphate synthase  40.52 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0914  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.1 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0250  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.18 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.55 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.03 
 
 
266 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.92 
 
 
258 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.96 
 
 
262 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1651  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.73 
 
 
229 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.885252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.8 
 
 
266 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
262 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2818  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
289 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.08 
 
 
260 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.3 
 
 
266 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.87 
 
 
264 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.12 
 
 
274 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.19 
 
 
269 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.44 
 
 
267 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.73 
 
 
229 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
266 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.89 
 
 
295 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.02 
 
 
271 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.12 
 
 
258 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.12 
 
 
258 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.32 
 
 
262 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.07 
 
 
260 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.23 
 
 
286 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.12 
 
 
258 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.4 
 
 
265 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.55 
 
 
271 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.82 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.66 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.4 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.76 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.55 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0333  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.18 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1631  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.3 
 
 
259 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
295 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
293 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.12 
 
 
268 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
293 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
267 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.34 
 
 
272 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.09 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.11 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.86 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.83 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.86 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.81 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1210  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.46 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.33 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.85 
 
 
266 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.38 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.72 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.62 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.03 
 
 
267 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.78 
 
 
267 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.01 
 
 
266 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.23 
 
 
263 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.75 
 
 
271 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
276 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
261 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.48 
 
 
279 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2155  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.24 
 
 
260 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.209706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.29 
 
 
262 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.04 
 
 
267 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.38 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.74 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0107  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.73 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.45 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.66 
 
 
278 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.83 
 
 
263 aa  136  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
265 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.43 
 
 
270 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.45 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.54 
 
 
278 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.33 
 
 
267 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.45 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>