61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2685 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  100 
 
 		 292 aa  584  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  43.6 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  38.1 
 
 		 179 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  42.86 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  43.1 
 
 		 224 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  42.31 
 
 		 160 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  42.34 
 
 		 210 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  44.35 
 
 		 186 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  37.58 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  41.74 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  41.53 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  39.13 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  43.4 
 
 		 136 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  34.38 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  34.38 
 
 		 119 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  34.38 
 
 		 119 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  34.48 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  35.79 
 
 		 119 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  36.84 
 
 		 116 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  33.64 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  34.09 
 
 		 147 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  34.74 
 
 		 126 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  34.44 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  36.56 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  34.74 
 
 		 116 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  33.68 
 
 		 116 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  33.02 
 
 		 127 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  34.02 
 
 		 116 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  32.26 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  27.66 
 
 		 146 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  27.66 
 
 		 168 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  32.26 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  35.44 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.36 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  34.38 
 
 		 128 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  30.56 
 
 		 807 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  33.68 
 
 		 116 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  29.13 
 
 		 104 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.96 
 
 		 85 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  41.67 
 
 		 110 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  32.99 
 
 		 116 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  38.03 
 
 		 157 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  38.46 
 
 		 119 aa  45.8  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  33.7 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  38.89 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  44.26 
 
 		 114 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  30.85 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  44.26 
 
 		 114 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  38.89 
 
 		 113 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  40.28 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  31.46 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  38.89 
 
 		 112 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  38.89 
 
 		 112 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  34.15 
 
 		 150 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  38.89 
 
 		 112 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  38.81 
 
 		 179 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  35 
 
 		 137 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  31.13 
 
 		 144 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  26.6 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>