64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1621 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
110 aa  223  9e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  50.54 
 
 
172 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  43.75 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  36.04 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  34.58 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  35.51 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  39.76 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  36.45 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  35.25 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  35.37 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  30.36 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  38.55 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  34.58 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  35.37 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  34.68 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  39.02 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  32.93 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  32.93 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  35.29 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  35.71 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  36.63 
 
 
347 aa  52  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  31.68 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  37.65 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  33 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  35.71 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  34.07 
 
 
235 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  33.33 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  36.26 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  38.54 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  32.22 
 
 
143 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  31.31 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  37.35 
 
 
210 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  30.53 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  37.35 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  36.96 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  37.08 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  33.67 
 
 
807 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  37.35 
 
 
212 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  30.69 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  28.81 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  31.4 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  29.89 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  29.47 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  34.83 
 
 
139 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  30.59 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  31.87 
 
 
292 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  31 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  38.37 
 
 
358 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  25.71 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  36.78 
 
 
131 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  36.14 
 
 
209 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  28.09 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  32.93 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  28.42 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  50 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  33.64 
 
 
209 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  32.86 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  36.9 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  34.94 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  36.59 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  30.43 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  32.18 
 
 
123 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  32.11 
 
 
168 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>