More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2065 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2065  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0370396  normal  0.164629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1216  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  63.81 
 
 		 216 aa  267  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.556925  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  64.45 
 
 		 209 aa  258  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1609  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  56.81 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.439334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.9 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  34.07 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  26.84 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  28.92 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1998  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  34.59 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  34.87 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  32.62 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  31.61 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1789  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.15 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160371  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  28.88 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3148  HAD family hydrolase  35.06 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0274068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3160  HAD family hydrolase  35.06 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0720917  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3210  HAD family hydrolase  35.06 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.742759  normal  0.278604 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  28.88 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  32.47 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  29.83 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  26.52 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  29.78 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.84 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  30.94 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.67 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  33.16 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  38.04 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  29.23 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  29.05 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0332  HAD family hydrolase  24.46 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2802  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.88 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.978362  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30.57 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  32.79 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  27.89 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  29.89 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  26.46 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  27.55 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.36 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  29.26 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0815  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.6 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.49888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.98 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.05 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  33.54 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  26.26 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  27.47 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.94 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.7 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>