More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1723 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1723  ABC transporter related  100 
 
 
324 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0159508  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  50 
 
 
301 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0350  ABC transporter related  54.45 
 
 
239 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  40.85 
 
 
301 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2967  ABC transporter related  48.56 
 
 
266 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  44.39 
 
 
301 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  41.98 
 
 
301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  42.45 
 
 
301 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 
316 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  40.37 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  38.68 
 
 
306 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.18 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 
331 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.6 
 
 
303 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  35.78 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 
282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  40.65 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
304 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
304 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  40.91 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  36.74 
 
 
302 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  41.98 
 
 
333 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  38.26 
 
 
747 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.45 
 
 
337 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  35.27 
 
 
348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
304 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  35.27 
 
 
348 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
301 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  31.56 
 
 
295 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  33.92 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  34.55 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.78 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  35.94 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  34.96 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  35.65 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  38.84 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  41.04 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  37.8 
 
 
318 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.46 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  35.75 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  35.14 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  35.85 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  36.67 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  35.05 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  39.17 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  36.25 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  40 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  40 
 
 
359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
335 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  40.57 
 
 
295 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
305 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  37.2 
 
 
293 aa  126  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  41.71 
 
 
284 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  38.32 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  34.25 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  34.25 
 
 
331 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  36.88 
 
 
290 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 
300 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  35.98 
 
 
341 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  39.67 
 
 
236 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  37.14 
 
 
345 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  41.36 
 
 
286 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.25 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  32.86 
 
 
302 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.25 
 
 
331 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
331 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  36.67 
 
 
345 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  40.09 
 
 
238 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  31.58 
 
 
299 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  34.11 
 
 
303 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
342 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.7 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
288 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  36.48 
 
 
310 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  35 
 
 
306 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  36.48 
 
 
310 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.7 
 
 
303 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  33.94 
 
 
303 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
373 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
242 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  40.09 
 
 
301 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
302 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  37.95 
 
 
310 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  38.24 
 
 
309 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
308 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  38.99 
 
 
324 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  29.33 
 
 
230 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  37.13 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  36.4 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.19 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  39.35 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  30.73 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>