More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1235 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 482 aa  931    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.14 
 
 		 478 aa  555  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  59.67 
 
 		 483 aa  514  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.05 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.3 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.93 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  43.14 
 
 		 502 aa  336  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  42.42 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.82 
 
 		 514 aa  307  3e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.31 
 
 		 507 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.13 
 
 		 501 aa  305  9.000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.42 
 
 		 504 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  42.98 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.13 
 
 		 501 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.8 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.87 
 
 		 480 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.08 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.67 
 
 		 504 aa  269  8e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.19 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  40.04 
 
 		 479 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.71 
 
 		 467 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.19 
 
 		 542 aa  261  2e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.08 
 
 		 503 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.12 
 
 		 505 aa  248  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.53 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.57 
 
 		 510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 		 530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.4 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.39 
 
 		 524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.31 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.63 
 
 		 513 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.76 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 		 498 aa  195  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 		 518 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 		 500 aa  193  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.33 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.98 
 
 		 533 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.88 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  34.24 
 
 		 514 aa  187  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.62 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.79 
 
 		 514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  35.2 
 
 		 522 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  31.66 
 
 		 524 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.31 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.12 
 
 		 524 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.98 
 
 		 528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.91 
 
 		 516 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.93 
 
 		 492 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.14 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 		 517 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.33 
 
 		 501 aa  177  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  32.18 
 
 		 512 aa  176  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.06 
 
 		 499 aa  176  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  34.6 
 
 		 519 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  27.07 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.08 
 
 		 533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.02 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.29 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.72 
 
 		 524 aa  172  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.58 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  32.18 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  27.33 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  35.21 
 
 		 499 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  28.99 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  33.48 
 
 		 462 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 525 aa  170  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.85 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.37 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  29.8 
 
 		 524 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  29.76 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 		 506 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.14 
 
 		 492 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  32.32 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  32.19 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.68 
 
 		 511 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.3 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.75 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.33 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  32.19 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.87 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  32.06 
 
 		 515 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.67 
 
 		 494 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  32.06 
 
 		 515 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  32.06 
 
 		 515 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.06 
 
 		 515 aa  163  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.79 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  32.06 
 
 		 515 aa  163  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  31.16 
 
 		 493 aa  163  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  32.06 
 
 		 510 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.99 
 
 		 504 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.25 
 
 		 502 aa  162  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.02 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  31.03 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.99 
 
 		 504 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.01 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  32.47 
 
 		 503 aa  161  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.79 
 
 		 504 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  33.47 
 
 		 496 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>