173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0655 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
350 aa  696    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  73.3 
 
 
352 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  74.15 
 
 
352 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  71.95 
 
 
353 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  71.02 
 
 
353 aa  504  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  52.59 
 
 
356 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  51.84 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50.73 
 
 
360 aa  324  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  46.88 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50.15 
 
 
359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  49.1 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  47.66 
 
 
359 aa  306  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  47.8 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  46.47 
 
 
360 aa  288  8e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.92 
 
 
351 aa  238  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 
351 aa  226  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  35.23 
 
 
354 aa  212  9e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  40.58 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 
334 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  39.05 
 
 
342 aa  194  3e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  41.33 
 
 
341 aa  193  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  36.47 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  36.23 
 
 
338 aa  189  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  37.08 
 
 
342 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  36.73 
 
 
342 aa  187  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.76 
 
 
334 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  39.27 
 
 
334 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  39.69 
 
 
334 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.6 
 
 
355 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  32.42 
 
 
355 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
349 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.42 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.82 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.37 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  34.96 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.88 
 
 
349 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 
349 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  29.84 
 
 
403 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  35.04 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  28.53 
 
 
351 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  32.01 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  31.64 
 
 
353 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  28.72 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.73 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.41 
 
 
399 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  30.19 
 
 
419 aa  105  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  28.73 
 
 
419 aa  92  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.05 
 
 
403 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.53 
 
 
403 aa  86.3  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.82 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  29.47 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.18 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  29.61 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  31.55 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  29.25 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  24.44 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  27.1 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  27.1 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  27.55 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.13 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.18 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  28.24 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  26.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  26.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  26.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  26.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  26.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  26.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  26.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  26.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  32.16 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  27.3 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
381 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.12 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  24.14 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.84 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.05 
 
 
364 aa  63.5  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.15 
 
 
368 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  26.56 
 
 
366 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  30.8 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.41 
 
 
364 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.89 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
363 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  25.55 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  28.71 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  23.61 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>