152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0608 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  54.88 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  55.28 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  56.09 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  53.78 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  60.22 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  48.96 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  41.63 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  45.6 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  45.6 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  44.86 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  44.5 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  46.32 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  44.56 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  44.15 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  43.23 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  41.38 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  37.37 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  40.1 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  45.95 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  39.89 
 
 		 207 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  43.75 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.46 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  41.44 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.26 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  39.23 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  36.26 
 
 		 204 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  35.92 
 
 		 217 aa  122  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  34.57 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  36.51 
 
 		 203 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  36.96 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  38.67 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  36.41 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  34.04 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  35.11 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  32.85 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  32.8 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  31.47 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  32.24 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  34.18 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  33.65 
 
 		 297 aa  98.6  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  30.61 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  35.75 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  31.82 
 
 		 206 aa  93.6  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  29.13 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  28.97 
 
 		 301 aa  92.8  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  30.89 
 
 		 201 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  31.16 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  29.46 
 
 		 284 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  30.97 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  29.77 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  33.5 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  30.05 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  31.43 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  32.54 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  29.57 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  32.14 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  33.33 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  30.85 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  31.58 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  31.84 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  32.77 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  31.46 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  30.48 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  28 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  30.73 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  28 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  30.53 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  24.78 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  29.84 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  27.98 
 
 		 302 aa  75.1  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  25.53 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  27.56 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  30.93 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  33.33 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  33.33 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  29.74 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  33.33 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  32.79 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  34.16 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  25.5 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.18 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  31.58 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  27.83 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  28.78 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02950  endopeptidase, putative  28.51 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0631891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  28.57 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  30.7 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  29.82 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  31.15 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  26.56 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  26.06 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  26.23 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  29.55 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  29.26 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  23.35 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  30.48 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  28.24 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  24.87 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>