93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0340 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0340  protein of unknown function DUF87  100 
 
 		 379 aa  722    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0311557 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0340  ATPase-like protein  54.47 
 
 		 359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0213  hypothetical protein  51.93 
 
 		 363 aa  339  4e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0846575  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2628  hypothetical protein  50.26 
 
 		 351 aa  322  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.791354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  34.19 
 
 		 445 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  29.46 
 
 		 396 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  27.25 
 
 		 508 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.44 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  27.6 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  25 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.73 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  26.9 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  28.91 
 
 		 616 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3943  hypothetical protein  28.1 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  27.78 
 
 		 611 aa  70.1  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  29.65 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  27.96 
 
 		 608 aa  69.3  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.59 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.8 
 
 		 623 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  30.54 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  20.4 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  29.94 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.14 
 
 		 679 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  28.07 
 
 		 709 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  21.62 
 
 		 496 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  33.54 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  31.1 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  26.8 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  30.72 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.53 
 
 		 599 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  29.87 
 
 		 579 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  28.69 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  28.92 
 
 		 659 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  32.32 
 
 		 577 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  28.08 
 
 		 617 aa  57  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  27.78 
 
 		 595 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  24.86 
 
 		 560 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  27.1 
 
 		 628 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  35.29 
 
 		 544 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  27.95 
 
 		 594 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  27.38 
 
 		 655 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  31.03 
 
 		 591 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  27.27 
 
 		 587 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  27.06 
 
 		 563 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  34.17 
 
 		 569 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  34.15 
 
 		 570 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  53.1  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  26.98 
 
 		 679 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.76 
 
 		 674 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  30.91 
 
 		 583 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  26.04 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  30 
 
 		 653 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  27.87 
 
 		 557 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  27.51 
 
 		 674 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  35.29 
 
 		 570 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  28.32 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  24.66 
 
 		 607 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  28.26 
 
 		 583 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  19.83 
 
 		 510 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  26.09 
 
 		 591 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  32.26 
 
 		 590 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  28.26 
 
 		 628 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  30.26 
 
 		 537 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  28.22 
 
 		 617 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  19.11 
 
 		 497 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  25.62 
 
 		 499 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  31.58 
 
 		 560 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  29.7 
 
 		 584 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  31.75 
 
 		 574 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  29.31 
 
 		 658 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  24.77 
 
 		 662 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  28.4 
 
 		 579 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  25.94 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  22.45 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  28.22 
 
 		 582 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  24.84 
 
 		 659 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.98 
 
 		 714 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  20.61 
 
 		 540 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  28.68 
 
 		 664 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  35.14 
 
 		 612 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.45 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  20.27 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  30.58 
 
 		 606 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  30.06 
 
 		 583 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  23.86 
 
 		 709 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  26.8 
 
 		 626 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  36.71 
 
 		 603 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  22.3 
 
 		 581 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  24.58 
 
 		 526 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  23.64 
 
 		 561 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  28.25 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  18.56 
 
 		 497 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  22.57 
 
 		 517 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>