50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0825 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  50.41 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  49.59 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  50.72 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  38.98 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  36.07 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  37.72 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  34.59 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  31.88 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  32.31 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  32.23 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  29.17 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  33.59 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  29.66 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  31.58 
 
 		 271 aa  53.9  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  28.36 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  25.78 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  31.78 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  27.93 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  31.67 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  34.26 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  33.6 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  33.04 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  40.7 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  29.71 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  27.36 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  25 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  26.09 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  27.21 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 241 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  35.87 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.08 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  29.73 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  37.18 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  21.88 
 
 		 140 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  27.56 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  26.19 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  26.42 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  29 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  33.61 
 
 		 137 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>